Λίγα μόλις χιλιόμετρα βορειοανατολικά από τον οικισμό της Μιλάτου, Αγίου Νικολάου Λασιθίου, βρίσκεται το ομώνυμο σπήλαιο.

Στην είσοδο του σπηλαίου συναντά κανείς το μνημείο προς τιμήν των χιλιάδων αμάχων, που σφαγιάσθηκαν από τον στρατό του Χασάν Πασά, κατά την διάρκεια της Τουρκοκρατίας. Στην μνήμη των πεσόντων χτίστηκε στο εσωτερικό του σπηλαίο ένα μικρό εκκλησάκι.

Ωστόσο, αρχαιολογικές έρευνες πιστοποιούν την αξιοποίηση του σπηλαίου από την Νεολιθική περίοδο.

Το σπήλαιο αποτελείται από αίθουσες διαφορετικών επιπέδων και είναι ανοιχτό για τους επισκέπτες.